細胞類型指南和優化
BLU includes 7 system cell types:
- BCI Default – general use
- Mammalian - CHO, HEK, PBMC
- Insect – SF-9, SF-21
- Yeast- biofuel, breweries, fermentation applications
- BCI Viab Beads – for use with BLU viability control
- BCI Conc Beads – for use with BLU concentration controls
- BCI L10 Beads – for use with L10 (10um) size standard
對於許多細胞類型,軟體中提供的默認細胞類型值即適用。對於某些細胞 系,需要更改參數,以優化對細胞的分析。
Migrating cell types from XR to BLU
Suggested conversion values. Please contact your Beckman Coulter Life Sciences representative for more assistance.
XR Setting | BLU Setting Starting Value | |
---|---|---|
Min | Same | -1 um |
Max | Same | -1 um |
Images | 50 | 50 or 100 |
Aspirate | Same | 3 |
Mix | Same | 3 |
Cell Brightness | 85 | N/A |
Cell Sharpness | 100 | 7 |
80 | 15 | |
60 | 20 | |
Viable Spot Brightness | 85 | 55 |
75 | 50 | |
65 | 40 | |
Viable Spot Area | Same | Same |
Min Circularity | Same | Same |
Decluster | Same | Same |
細胞類型參數 | 典型範圍 | 全範圍 | 增加值 | 減小值 | 需要更改此值的情況/原因 | 警告 | |
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定義是否存在細胞 |
Minimum Diameter(最小直徑) |
5 到 12µm |
1 到 60 µm |
識別的細胞減少 |
識別的細胞增多 |
軟體要排除小細胞(藍色圓形) 分析中包含的碎片 |
過低,可能包含碎片 過高,已排除細胞 |
Maximum Diameter(最大直徑) |
15 到 50 µm |
1 到 60 µm |
識別的細胞增多 |
識別的細胞減少 |
軟體要排除大細胞(藍色圓形) 已包括細胞凝塊 |
過低,可能排除細胞 包括細胞凝塊 |
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Cell Sharpness(細胞清晰度) |
5 到 25 |
0 到 100 |
識別的細胞減少 |
識別的細胞增多 |
軟體要排除“模糊”細胞 已挑選出不需要的碎片 |
設置過高可能會導致排除死細胞並改變存活率。 |
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定義識別的細胞是活細胞還是死細胞 |
Viable Cell Spot Brightness(活細胞斑點亮度) |
40 至 60% |
0 至 95% |
將更多細胞識別為死細胞 |
將更多細胞識別為活細胞 |
活細胞被識別為死細胞 死細胞被識別為活細胞 |
過低,可能開始將死細胞識別為活細胞 過高,可能開始將活細胞識別為死細胞 |
Viable Cell Spot Area(活細胞斑點區域) |
3 至 12% |
0 to 95% |
將更多細胞識別為死細胞 |
將更多細胞識別為活細胞 |
活細胞被識別為死細胞 死細胞被識別為活細胞 |
過低,可能開始將死細胞識別為活細胞 過高,可能開始將活細胞識別為死細胞 |
|
定義是否存在細胞 |
Minimum Circularity(最小圓度) |
0 至 0.60 |
0 至 1.00 |
將排除更多不規則形狀死細胞 |
將排除更少不規則形狀死細胞 |
會挑選出不需要的不規則形狀碎片 |
過低,可能會捕獲不需要的碎片 過高,可能開始排除細胞 |
Decluster Degree(去簇度) |
None(無)、Low(低)到 Medium(中) |
不適用 |
識別的細胞增多 |
識別的細胞減少 |
會遺漏簇群中的細胞 單個細胞被識別為 2 個或更多個細胞 |
過低,可能會遺漏簇群中的細胞 過高,可能會將單個細胞注釋為 2 個或多個細胞而予以過度去簇 |
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Cell Sharpness(細胞清晰度) |
Cell Sharpness(細胞清晰度)是細胞邊緣的度量值(在 0-100 范圍之間)。降低該值,可以將更為模糊的對象識別為細胞。提高清晰度,可以在細胞計數時排除較為模糊的細胞。 |
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Viable Cell Spot Brightness(活細胞斑點亮度) |
Viable Cell Spot Brightness(活細胞斑點亮度)測量細胞中心的亮度,以確定細胞有無活性(綠色或紅色注釋)。如使用較高值,則將中心為亮白色的細胞計數為活細胞(存活率會降低)。如使用較低值,則將中心為灰色的細胞計數為活細胞(存活率會升高)。必須檢查注釋,以確定 Viable Cell Spot Brightness(活細胞斑點亮度)的設置是否正確,這至關重要。 |
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Viable Cell Spot Area(活細胞斑點區域) |
Viable Cell Spot Area(活細胞斑點區域)是細胞白色區域的百分比,用於確定細胞有無活性。如該值過高,會導致將某些活細胞計數為死細胞。一般來說,無需調整此參數。 |
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Minimum Circularity(最小圓度) |
此參數用於排除碎片。假設“1”是完美圓形。 |
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Decluster Degree(去簇度) |
去簇度定義將細胞簇群去簇的密度。None(無)是指不將任何細胞簇群去簇 - 適用於細胞非常長且不包含細胞簇群的樣本。Low(低)適用於 2-3 個細胞結成簇群的樣本。Medium(中)適用於一些由 3 個以上細胞結成簇群的樣本。High(高)適用於酵母細胞。 |