Apostle MiniMax 有效分離富集試劑組的實驗效能及數據

從血漿中進行 cfDNA 萃取以用於液體活檢

Apostle MiniMax 有效游離 DNA 萃取試劑組(標準盤)是基於磁珠技術的游離 DNA (cfDNA)萃取試劑組。Apostle MiniMax 試劑組已被證明在手動和自動化工作流程中從人類血漿中純化 cfDNA。

  • 可處理 1-5mL 血漿樣品
  • 與多種採血管相容
  • 使用該試劑盒萃取的 cfDNA 的純度被證明適用於下游 PCR 應用及 NGS 檢測s

與多種採血管相容

圖1(下圖):使用 Apostle MiniMax 試劑組和市場上主流萃取試劑組(Kit A)從 cfDNA Tube 1和 cfDNA Tube 2 中收集的 1mL 血漿中萃取 DNA。同時使用 Apostle MiniMax 試劑組、市場上主流萃取試劑組(Kit A)及磁珠萃取試劑盒(Kit B)從 EDTA 抗凝管 1mL 血漿中萃取 DNA。採用 Quant-iT PicoGreen dsDNA 檢測試劑組(Thermo Fisher)對 DNA 進行定量。Error bar 表示三個重複的標準偏差。對於每個樣品,Apostle Max 試劑組有較高的 DNA 萃取產量。使用安捷倫生物分析儀 2100 進行分析 DNA 片段大小,實驗證明,從三種不同採血管中萃取 DNA,均可獲得預期片段大小   cfDNA(±170 bp)。

Genomics cfDNA Yield from Plasma 

卓越的再現性

圖2(下圖):使用 Apostle MiniMax 試劑組和其他品牌試劑組從 cfDNA Tube 1 和 cfDNA Tube 2 中收集的 1mL 血漿中萃取 DNA,每種方法重複一次,結果顯示,採用 Apostle MiniMax 試劑組萃取的兩個樣品幾乎相同,而使用試劑組 A 萃取 DNA 的曲線則明顯不同 。使用安捷倫生物分析儀 2100 分析分離的 cfDNA;波峰 35 和波峰 10380 為內部QC。

Genomics cfDNA from Plasma Reproducibility

圖 3( A),分別採用 Apostle MiniMax 試劑組(紅色曲線)和市場主流的萃取試劑組(藍色曲線)從 4 mL 血漿中分離富集 cfDNA。萃取的 cfDNA 使用生物分析儀 2100 分析。圖 3(B)顯示,分別採用 Apostle MiniMax 試劑組(紅色曲線)和市場主流的萃取試劑盒(藍色曲線)從 20 mL 尿液中分離富集 cfDNA。萃取的 cfDNA 使用生物分析儀 2100 分析,並標出 ~170bp 的主要波峰。波峰 35 和波峰10380 是內部QC。如圖示,對於血漿和尿液樣品,Apostle MiniMax 試劑組的表現優於主要替代產品。

Genomics cfDNA Isolation Characterized

DNA 突變檢測和 qPCR 驗證

在圖 4 中,將 20µL 含有 EGFR C2573T>G L858R 突變的 DNA 合成片段(170 bp)摻入 1mL 的 TE 緩衝液(藍色)或血清(紅色),濃度範圍為 0.001ng/µL 到 1ng/µL。使用 Apostle MiniMax 試劑組萃取:A) 擴增曲線,顯示突變片段在各個稀釋濃度上, 使用 MiniMaxTM 有效游 離 DNA 分離富集試劑組萃取前和萃取後呈現高度的重疊,B)用突變 DNA 片段標準品原液進行螢光定量 PCR,並得出標準曲 線。將 MiniMaxTM 有效游離 DNA 分離富集試劑組萃取後產物曲線與之對 比,呈現出 DNA 片段 90% 以上的萃取效率。在圖 5中,使用 Aposlte MiniMax 試劑盒和其他市場主流的萃取試劑組(Kit A)之間的 qPCR 表現進行了比較。如圖示,實驗證明,從三種不同採血管中萃取 DNA,Apostle MiniMax 試劑組比試劑組 A 表現更優異。

Genomics cfDNA Mutation DetectionGenomics cfDNA qPCR Performance

DNA 產量隨血液樣品增加而提高

在圖 6 中,從 Apostle MiniMax EDTA 管中的 1、3 和 5 mL 血漿中萃取 DNA。如果使用 Apostle MiniMax 試劑組,DNA產量會隨著樣品起始量增加而增加。使用 Quant–iT PicoGreen dsDNA 檢測試劑組(Thermo Fisher)對 DNA 進行定量。Error bar 表示三個複製的標準偏差。

Genomics cfDNA Yield Input Volume

工作流程圖

Genomics cfDNA Apostle MiniMax Workflow

  1. 血漿裂解
  2. cfDNA 與磁珠結合
  3. 磁珠與污染物分離
  4. 清洗磁珠
  5. 再次清洗磁珠
  6. 洗脫 cfDNA

 

產品:Apostle MiniMax 游離 DNA 萃取試劑盒(標準版)

Apostle MiniMax 試劑組可根據您的實驗通量需求提供三種試劑組規格:

PART # NAME PREPS
C40603 Apostle MiniMax™ 50
C40604 Apostle MiniMax™ 10
C40605 Apostle MiniMax™ Large Volume 50

評估 Apostle MiniMax 有效游離 DNA 提取試劑組

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