Apostle MiniMax 有效分離富集試劑組的實驗效能及數據
從血漿中進行 cfDNA 萃取以用於液體活檢
Apostle MiniMax 有效游離 DNA 萃取試劑組(標準盤)是基於磁珠技術的游離 DNA (cfDNA)萃取試劑組。Apostle MiniMax 試劑組已被證明在手動和自動化工作流程中從人類血漿中純化 cfDNA。
- 可處理 1-5mL 血漿樣品
- 與多種採血管相容
- 使用該試劑盒萃取的 cfDNA 的純度被證明適用於下游 PCR 應用及 NGS 檢測s
與多種採血管相容
圖1(下圖):使用 Apostle MiniMax 試劑組和市場上主流萃取試劑組(Kit A)從 cfDNA Tube 1和 cfDNA Tube 2 中收集的 1mL 血漿中萃取 DNA。同時使用 Apostle MiniMax 試劑組、市場上主流萃取試劑組(Kit A)及磁珠萃取試劑盒(Kit B)從 EDTA 抗凝管 1mL 血漿中萃取 DNA。採用 Quant-iT PicoGreen dsDNA 檢測試劑組(Thermo Fisher)對 DNA 進行定量。Error bar 表示三個重複的標準偏差。對於每個樣品,Apostle Max 試劑組有較高的 DNA 萃取產量。使用安捷倫生物分析儀 2100 進行分析 DNA 片段大小,實驗證明,從三種不同採血管中萃取 DNA,均可獲得預期片段大小 cfDNA(±170 bp)。
卓越的再現性
圖2(下圖):使用 Apostle MiniMax 試劑組和其他品牌試劑組從 cfDNA Tube 1 和 cfDNA Tube 2 中收集的 1mL 血漿中萃取 DNA,每種方法重複一次,結果顯示,採用 Apostle MiniMax 試劑組萃取的兩個樣品幾乎相同,而使用試劑組 A 萃取 DNA 的曲線則明顯不同 。使用安捷倫生物分析儀 2100 分析分離的 cfDNA;波峰 35 和波峰 10380 為內部QC。
圖 3( A),分別採用 Apostle MiniMax 試劑組(紅色曲線)和市場主流的萃取試劑組(藍色曲線)從 4 mL 血漿中分離富集 cfDNA。萃取的 cfDNA 使用生物分析儀 2100 分析。圖 3(B)顯示,分別採用 Apostle MiniMax 試劑組(紅色曲線)和市場主流的萃取試劑盒(藍色曲線)從 20 mL 尿液中分離富集 cfDNA。萃取的 cfDNA 使用生物分析儀 2100 分析,並標出 ~170bp 的主要波峰。波峰 35 和波峰10380 是內部QC。如圖示,對於血漿和尿液樣品,Apostle MiniMax 試劑組的表現優於主要替代產品。
DNA 突變檢測和 qPCR 驗證
在圖 4 中,將 20µL 含有 EGFR C2573T>G L858R 突變的 DNA 合成片段(170 bp)摻入 1mL 的 TE 緩衝液(藍色)或血清(紅色),濃度範圍為 0.001ng/µL 到 1ng/µL。使用 Apostle MiniMax 試劑組萃取:A) 擴增曲線,顯示突變片段在各個稀釋濃度上, 使用 MiniMaxTM 有效游 離 DNA 分離富集試劑組萃取前和萃取後呈現高度的重疊,B)用突變 DNA 片段標準品原液進行螢光定量 PCR,並得出標準曲 線。將 MiniMaxTM 有效游離 DNA 分離富集試劑組萃取後產物曲線與之對 比,呈現出 DNA 片段 90% 以上的萃取效率。在圖 5中,使用 Aposlte MiniMax 試劑盒和其他市場主流的萃取試劑組(Kit A)之間的 qPCR 表現進行了比較。如圖示,實驗證明,從三種不同採血管中萃取 DNA,Apostle MiniMax 試劑組比試劑組 A 表現更優異。
DNA 產量隨血液樣品增加而提高
在圖 6 中,從 Apostle MiniMax EDTA 管中的 1、3 和 5 mL 血漿中萃取 DNA。如果使用 Apostle MiniMax 試劑組,DNA產量會隨著樣品起始量增加而增加。使用 Quant–iT PicoGreen dsDNA 檢測試劑組(Thermo Fisher)對 DNA 進行定量。Error bar 表示三個複製的標準偏差。
工作流程圖
- 血漿裂解
- cfDNA 與磁珠結合
- 磁珠與污染物分離
- 清洗磁珠
- 再次清洗磁珠
- 洗脫 cfDNA
產品:Apostle MiniMax 游離 DNA 萃取試劑盒(標準版)
Apostle MiniMax 試劑組可根據您的實驗通量需求提供三種試劑組規格:
PART # | NAME | PREPS |
---|---|---|
C40603 | Apostle MiniMax™ | 50 |
C40604 | Apostle MiniMax™ | 10 |
C40605 | Apostle MiniMax™ Large Volume | 50 |
評估 Apostle MiniMax 有效游離 DNA 提取試劑組
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