GenFind V3 試劑組的效能和數據

從血液和血清中分離的基因體 DNA

GenFind V3 試劑組是一款基於 SPRI 磁珠技術的基因體 DNA(gDNA)萃取試劑組。可從含抗凝劑(如 EDTA、枸櫞酸鹽或肝素)的新鮮或冷凍血液中提取得到可用於 PCR 的 gDNA。該方法既適用於 2mL 離心管或 96 孔板進行手工操作,也適用於貝克曼庫爾特 Biomek 移液工作站進行自動化操作。相較於其他供應商的血液 gDNA 提取試劑盒產品, GenFind V3 試劑盒具有始終如一的提取性能。

  • 所提取 gDNA 具有高質量和高純度
  • 無任何抗凝劑殘留,對 PCR 和其他下游反應無抑制
  • 處理高達 400µL 的新鮮或冷凍血液

gDNA 競爭性的回收率和純度

使用 GenFind V3 試劑盒和其他供應商的試劑盒從 200 µL 新鮮或冷凍血樣中提取 gDNA,血樣分別含有肝素、EDTA 和檸檬酸鈉抗凝劑。(1) 使用 Quant-iT DNA 檢測試劑組、Picogreen NanoDropThermo Fisher Scientific)對 gDNA 產量進行定量分析。在含有 EDTA 的樣品中,GenFind V3 試劑組萃取 gDNA 產量高於其他供應商試劑組,在含有肝素和檸檬酸鈉的樣品中 GenFind V3 試劑組萃取 gDNA 的產量也具有競爭優勢。(圖2)使用 NanoDropThermo Fisher Scientific)測定樣品純度。無論是新鮮還是冷凍血液樣品,GenFind V3 試劑組所萃取的 gDNA 均具有理想的A260/280 比值。

GenFind V3 gDNA YieldGenFind V3 Purity DNA Isolation

 

採用 GenFind V3試劑組萃取高純度的 gDNA

使用 GenFind V3 試劑組、GenFind V2 試劑組和三種其他供應商的試劑組從 200 µL 新鮮或冷凍血液中萃取 gDNA,所用血液分別含有抗凝劑肝素、EDTA 和檸檬酸鈉。使用 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)測定 gDNA 純度。無論在何種抗凝劑存在條件下,GenFind V3 試劑組所萃取 gDNA 的純度均高於 GenFind V2 試劑組和其他供應商的試劑組。

GenFind V3 DNA Purity Data

產量隨血液樣品增加而提高

增加血液樣品量可以提高總產量且不影響純度。使用 GenFind V3 從 400 µL 新鮮血液中萃取 gDNA,所用血液含有抗凝劑 EDTA。使用 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)測定 gDNA 純度和產量。

GenFind V3 DNA Yield DataGenFind V3 Purity DNA Isolation from Blood

無 PCR 和下游應用抑制劑殘留

透過 qPCR 進行 PCR 能力評價,該引子組(正向引子 5´-ggacttcgagcaagagatgg-3´ 和反向引子 5´-agcactgtgttggcgtacag-3´)擴增片段為跨越 β-肌動蛋白基因(ActB)的第 4 個和第 5 個外顯子,片段大小為 327bp。(左圖)從含有抗凝劑檸檬酸鈉、EDTA 或肝素的血液樣品中萃取的 10ng  gDNA 擴增曲線圖;所有萃取 gDNA 產物均可以進行 DNA 擴增,表明未殘留任何抗凝劑類的 PCR 抑制劑。(右圖)使用 GenFind V3 試劑組和 GenFind V2 試劑組從含有檸檬酸鈉的血液樣品中萃取的 10ng  gDNA 擴增曲線圖。

GenFind V3 Fresh Whole Blood DNA IsolationGenFind V3 Frozen Whole Blood DNA Isolation

對高分子量 DNA 具有高萃取效率

GenFind V3 試劑組萃取高質量 gDNA。從含肝素、EDTA 和檸檬酸鈉的血液樣品中萃取的 gDNA,在 Agilent Genomic DNA ScreenTape 上進行質量分析。(左圖)GenFind V3 萃取的所有 gDNA 其 DIN 值均 ≥ 9.0,表示萃取的 gDNA 質量高且完整性好。使用供應商 A 試劑組萃取 gDNA 質量偏低,DIN 值為7.8。(右圖)從含肝素和檸檬酸鈉的血液樣品中萃取的 gDNA 樣品波峰圖。 

 

GenFind V3 Performance Data DNA IsolationGenFind V3 Performance Data and Information

 

工作流程圖

GenFind V3 Workflow for DNA Isolation from Blood

1. 使用裂解液和蛋白酶 K 裂解全血或血清
2. 將 DNA 與磁珠結合
3. 將磁珠與雜質分離
4. 使用清洗緩衝液 1 清洗磁珠,以去除雜質
5. 使用清洗緩衝液 2 清洗磁珠,以去除雜質
6. 將 DNA 從磁珠上洗脫下來
7. 轉移到新孔盤存放

更少的移液器操作,減少手動操作時間

圖 11 表示使用 GenFind V3 試劑組或基於列操作的供應商 1 到 96 個樣品萃取 gDNA 的時間。GenFind V3 試劑組可實現更短的手動操作時間完成 DNA 萃取,即使在 10 個樣品的情況下。在圖 12 顯示 1、8、24、48 和  96 個樣品所需的移液操作總數。移液器操作包括加入樣品、混合樣品和丟棄上清液。使用多通道移液器,與其他的供應商相比,在 24 個或更多樣品情況下需要執行的移液器操作更少。

GenFind V3 Hands on TimeGenFind V3 Pipette Actions DNA Isolation

從血液中分離DNA的試劑組

GenFind V3 試劑組 可根據您的實驗通量需求提供 2 種試劑組規格。請聯繫您當地的業務代表或訪問我們的產品頁面,請求報價。

PART # NAME PREPS
C34880 GenFind V3 50
C34881 GenFind V3 384

 

Not intended or validated for use in the diagnosis of disease or other conditions.
© 2022 Beckman Coulter, Inc. All rights reserved. Beckman Coulter, the stylized logo and the Beckman Coulter product and service marks mentioned herein are trademarks or registered trademarks of Beckman Coulter, Inc. in the United States and other counters. All other trademarks are the property of their respective owners.

Genomic Reagents Support and Products

Talk To An Expert